alleleTools package

alleleTools: CLI toolkit for handling genetic alleles.

Author: Nicolás Mendoza Mejía License: GPL-3.0

Subpackages

• alleleTools.format package
  • setup_parser()
  • Subpackages
  • Submodules
• alleleTools.plot package
  • setup_parser()
  • Submodules
• alleleTools.tests package
  • Submodules
• alleleTools.utils package
  • Submodules

Submodules

• alleleTools.allele module
  • Allele
  • AlleleMatchStatus
  • AlleleParser
  • DelimitedParser
  • FieldTree
  • ParsingStrategy
  • RegexParser
  • Solution
• alleleTools.alleleTools module
  • main()
• alleleTools.argtypes module
  • add_out_altable_args()
  • check_dir_writable()
  • csv_file()
  • file_path()
  • output_path()
  • path()